Épisode 1
Le lieutenant Bud Roberts a été blessé dans l'explosion d'une mine. Il est évacué d'Afghanistan par hélicoptère. Coates l'accompagne...
Épisode 2
Harm et Mac sont chargés de défendre le caporal Maars. Il avait déserté son unité de Marines à cause de l'antisémitisme qu'il y avait senti, et rejoint les rangs de l'armée israélienne.
Épisode 3
Harm défend un sergent qui dit avoir tué sa femme en état de légitime défense. Mais il refuse que son fils témoigne en sa faveur.
Épisode 4
Au moment de l'arrivée à la Navy d'un nouveau secrétaire général, Harm traite une délicate affaire : une nouvelle recrue est accusée d'homicide involontaire...
Épisode 5
Harm et Mac enquêtent sur un F-14 ayant eu une défaillance d'oxygène liquide à quarante-cinq-mille pieds.
Épisode 6
Le jeune et séduisant lieutenant Kersey accuse de harcèlement sa supérieure, le Commandant O'Neill après un vol au dessus du Pacifique...
Épisode 7
La CIA décide de classer le dossier d'une tragédie maritime survenue dans les années 60. Harm, Mac et Turner s'insurgent en mémoire des cent-vingt-neuf hommes morts...
Épisode 8
Lorsqu'un exercice de simulation de combat tourne mal, l'amiral Chegwidden appelle le JAG à la rescousse. Le commandant de l'équipe rouge est accusé d'avoir désobéi aux ordres et d'avoir utilisé des armes chimiques, tuant le chef de l'équipe bleue...
Épisode 9
A bord du Seahawk, le lieutenant Singer veut poursuivre en cour martiale les personnes qu'elle juge responsables de la mort et de la blessure de deux seconds maîtres. Chegwidden envoie Harm vérifier les faits...
Épisode 10
En mission à Naples, Harmon doit collaborer avec Interpol pour débusquer l'auteur d'une série de meurtres de prostituées. Un marine américain est soupçonné...
Épisode 11
Coincé la veille de Noël sur l'USS Coral Sea avec l'amiral Boone, Harmon échafaude un plan pour rentrer au pays : les deux hommes échangent leurs places avec deux pilotes de F-14...
Épisode 12
Le général Chet Kubin déclare la guerre à la médecine navale quand sa fille Krista meurt des suites d'une opération bénigne...
Épisode 13
Après avoir fait des révélations à la presse à propos d'un nouveau casque high-tech, selon lui défectueux, le lieutenant Jeremy Duncan est menacé de cour martiale. Mac est chargée de l'affaire...
Épisode 14
Un vieil homme se rend au cimetière d'Arlington sur la tombe d'une infirmière ayant servi pendant la Seconde Guerre mondiale. Il raconte sa vie héroïque à une visiteuse âgée d'une vingtaine d'années...
Épisode 15
Un pilote américain est jugé pour avoir bombardé par erreur des troupes britanniques en Afghanistan. Mac, chargée de l'accusation, est soumise à la pression du secrétaire d'Etat à la Marine...
Épisode 16
L'Amiral A.J. Chegwidden est accidentellement éjecté d'un avion piloté par Harm. Il disparaît alors qu'une terrible tempête de neige se lève...
Épisode 17
Lorsqu'une torpille à ogive nucléaire disparaît mystérieusement d'un sous-marin de la base navale de Norfolk, cette dernière est bouclée. Sturgis se rend personnellement sur place pour enquêter et déterminer si la disparition de l'ogive est accidentelle ou si elle cache quelque chose de plus sinistre. Pendant ce temps, Harm est bloqué dans la base, où il est arrivé pour rechercher des preuves concernant un lieutenant accusé de vol et convoqué en cour martiale. Harm découvre rapidement des preuves impliquant un maître qui projette de dérober dix millions de dollars à la base.
Épisode 18
Lorsqu'un pilote de l'US Marine Corps, né au Vietnam et arrivé aux États-Unis comme réfugié après la chute de Saïgon, avoue un trafic d'êtres humains, Harm et Mac doivent enquêter pour découvrir la vérité avant son arrestation par les services d'immigration. Après l'éjection de Chegwidden d'un F-14, le commandant Theodore Lindsey se rend au JAG pour une évaluation à la demande du secrétaire à la Marine. Cet ancien officier d'état-major du JAG, impopulaire, s'en prend à tous ceux qu'il rencontre et promet de bouleverser l'institution où il a travaillé.
Épisode 19
Le bureau du JAG doit se mobiliser pour empêcher la mise en œuvre des recommandations du commandant Lindsey. Un marin du rang qui a empêché un attentat terroriste majeur en Ouzbékistan s'avère être la même personne que celle déclarée morte lors des attentats du 11 septembre.
Épisode 20
Le corps d'un officier de la Marine est retrouvé dans les bois par un jeune scout. Une analyse ADN permet de déterminer qu'il s'agit du lieutenant Loren Singer. Tandis que le NCIS mène l'enquête pour découvrir le meurtrier, Rabb appelle son frère Sergei pour lui apprendre la nouvelle. Interrogé comme les autres membres de l'équipe de l'amiral Chegwidden, Rabb est rapidement considéré comme le principal suspect...
Épisode 21
L'agent Gibbs poursuit son enquête concernant le terroriste Amad Bin Atwa. Harm, quant à lui, est traduit en cour martiale pour le meurtre du lieutenant Singer...
Épisode 22
Chargés de contrer les plans d'un groupe terroriste, MacKenzie et Webb se rendent au Paraguay, où ils se font passer pour un couple de jeunes mariés...
Épisode 23
Harm est très inquiet pour Mac. La jeune femme est toujours en mission au Paraguay avec Clayton Webb. Harm demande à Catherine Gale de l'aider à localiser précisément Mac...
Épisode 24
Harm apprend que Mac et Webb ont disparu au Paraguay. La CIA ignore s'ils sont encore en vie. Comme on lui refuse l'autorisation de partir à leur recherche, Harm démissionne du JAG et se rend au Paraguay tenter de les retrouver...
